MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 137095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002944	GGC	2	6	18218	18223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406114
502	NC_002944	CGA	2	6	18336	18341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406114
503	NC_002944	GGT	2	6	18348	18353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406114
504	NC_002944	GCG	3	9	18359	18367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406114
505	NC_002944	CG	3	6	18421	18426	0 %	0 %	50 %	50 %	41406114
506	NC_002944	GCC	2	6	18490	18495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406114
507	NC_002944	GGT	2	6	18544	18549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406114
508	NC_002944	CGGG	2	8	18568	18575	0 %	0 %	75 %	25 %	41406115
509	NC_002944	CGG	3	9	18669	18677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406115
510	NC_002944	GGCG	2	8	18684	18691	0 %	0 %	75 %	25 %	41406115
511	NC_002944	TGC	2	6	18724	18729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406115
512	NC_002944	CG	3	6	18735	18740	0 %	0 %	50 %	50 %	41406115
513	NC_002944	TGA	2	6	18746	18751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406115
514	NC_002944	GAT	3	9	18765	18773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406115
515	NC_002944	GC	3	6	18779	18784	0 %	0 %	50 %	50 %	41406115
516	NC_002944	CGG	2	6	18794	18799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406115
517	NC_002944	CAG	2	6	18804	18809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406115
518	NC_002944	GCCGG	2	10	18836	18845	0 %	0 %	60 %	40 %	41406115
519	NC_002944	GGGC	2	8	18846	18853	0 %	0 %	75 %	25 %	41406115
520	NC_002944	GCC	2	6	18858	18863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406115
521	NC_002944	GGCC	2	8	18867	18874	0 %	0 %	50 %	50 %	41406115
522	NC_002944	CCG	2	6	18879	18884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406115
523	NC_002944	CGGCG	2	10	18885	18894	0 %	0 %	60 %	40 %	41406115
524	NC_002944	GGA	2	6	18903	18908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406115
525	NC_002944	GCC	2	6	18916	18921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406115
526	NC_002944	GTG	2	6	18925	18930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406115
527	NC_002944	GCC	2	6	18946	18951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406115
528	NC_002944	CGCC	2	8	18957	18964	0 %	0 %	25 %	75 %	41406115
529	NC_002944	GCG	2	6	18968	18973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406115
530	NC_002944	CGG	2	6	18990	18995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406115
531	NC_002944	GC	3	6	19006	19011	0 %	0 %	50 %	50 %	41406115
532	NC_002944	C	6	6	19038	19043	0 %	0 %	0 %	100 %	41406115
533	NC_002944	TTC	2	6	19066	19071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406116
534	NC_002944	GCG	3	9	19123	19131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406116
535	NC_002944	ACC	2	6	19200	19205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406116
536	NC_002944	CAA	2	6	19213	19218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406116
537	NC_002944	CGT	2	6	19252	19257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406116
538	NC_002944	CGGCG	2	10	19322	19331	0 %	0 %	60 %	40 %	41406116
539	NC_002944	CGG	2	6	19426	19431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406116
540	NC_002944	GCCG	2	8	19495	19502	0 %	0 %	50 %	50 %	41406116
541	NC_002944	GGT	2	6	19621	19626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406116
542	NC_002944	GTG	2	6	19638	19643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406116
543	NC_002944	GCC	2	6	19763	19768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406116
544	NC_002944	TCC	2	6	19834	19839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406117
545	NC_002944	CGGCG	2	10	19873	19882	0 %	0 %	60 %	40 %	41406117
546	NC_002944	C	6	6	19889	19894	0 %	0 %	0 %	100 %	41406117
547	NC_002944	CCA	2	6	19923	19928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406117
548	NC_002944	GCG	2	6	19986	19991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406117
549	NC_002944	GT	3	6	19992	19997	0 %	50 %	50 %	0 %	41406117
550	NC_002944	CTG	2	6	20068	20073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
551	NC_002944	TTAGC	2	10	20106	20115	20 %	40 %	20 %	20 %	41406117
552	NC_002944	GCG	2	6	20124	20129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406117
553	NC_002944	CG	3	6	20134	20139	0 %	0 %	50 %	50 %	41406117
554	NC_002944	GCT	2	6	20142	20147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
555	NC_002944	GTG	3	9	20156	20164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406117
556	NC_002944	CCG	2	6	20225	20230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406117
557	NC_002944	GAT	2	6	20326	20331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406117
558	NC_002944	GC	3	6	20395	20400	0 %	0 %	50 %	50 %	41406117
559	NC_002944	TGC	2	6	20403	20408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
560	NC_002944	CTG	2	6	20476	20481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
561	NC_002944	GGTCG	2	10	20491	20500	0 %	20 %	60 %	20 %	41406117
562	NC_002944	CGGCG	2	10	20563	20572	0 %	0 %	60 %	40 %	41406117
563	NC_002944	GCT	2	6	20577	20582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
564	NC_002944	GCC	2	6	20612	20617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406117
565	NC_002944	GTG	2	6	20618	20623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406117
566	NC_002944	CGGG	2	8	20643	20650	0 %	0 %	75 %	25 %	41406117
567	NC_002944	TCG	2	6	20693	20698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
568	NC_002944	CGCCTG	2	12	20713	20724	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	41406117
569	NC_002944	CAG	2	6	20746	20751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406117
570	NC_002944	CGA	2	6	20770	20775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406117
571	NC_002944	ACC	2	6	20816	20821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406117
572	NC_002944	CGG	2	6	20833	20838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406117
573	NC_002944	GCC	2	6	20839	20844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406117
574	NC_002944	CTG	2	6	20851	20856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
575	NC_002944	GCC	2	6	20870	20875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406117
576	NC_002944	TGG	2	6	20895	20900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406117
577	NC_002944	CG	3	6	20916	20921	0 %	0 %	50 %	50 %	41406117
578	NC_002944	GAA	2	6	20935	20940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406117
579	NC_002944	TCG	2	6	20969	20974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
580	NC_002944	CAG	2	6	20983	20988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406117
581	NC_002944	CAG	2	6	21121	21126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406117
582	NC_002944	GCC	2	6	21130	21135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406117
583	NC_002944	TCG	2	6	21167	21172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
584	NC_002944	AGC	2	6	21173	21178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406117
585	NC_002944	GC	3	6	21200	21205	0 %	0 %	50 %	50 %	41406117
586	NC_002944	AGC	4	12	21245	21256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406117
587	NC_002944	GCC	2	6	21331	21336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406118
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589	NC_002944	CAG	2	6	21411	21416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
590	NC_002944	CGA	2	6	21435	21440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
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592	NC_002944	CGA	3	9	21503	21511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
593	NC_002944	CGG	2	6	21545	21550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406118
594	NC_002944	CAG	2	6	21552	21557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
595	NC_002944	ACGATG	2	12	21604	21615	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	41406118
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597	NC_002944	CCA	2	6	21644	21649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406118
598	NC_002944	GGC	2	6	21669	21674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406118
599	NC_002944	GAT	2	6	21675	21680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406118
600	NC_002944	GTCG	2	8	21684	21691	0 %	25 %	50 %	25 %	41406118
601	NC_002944	CGG	2	6	21695	21700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406118
602	NC_002944	CCG	2	6	21745	21750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406118
603	NC_002944	CAC	2	6	21817	21822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406118
604	NC_002944	GCACCC	2	12	21827	21838	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	41406118
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607	NC_002944	ACG	2	6	21947	21952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
608	NC_002944	CCGA	2	8	22000	22007	25 %	0 %	25 %	50 %	41406118
609	NC_002944	GCC	2	6	22018	22023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406118
610	NC_002944	AGC	2	6	22024	22029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
611	NC_002944	CG	3	6	22040	22045	0 %	0 %	50 %	50 %	41406118
612	NC_002944	GAA	2	6	22122	22127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406118
613	NC_002944	CAG	2	6	22131	22136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
614	NC_002944	CGG	2	6	22154	22159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406118
615	NC_002944	ACC	2	6	22318	22323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406118
616	NC_002944	CTG	2	6	22362	22367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406118
617	NC_002944	GTG	2	6	22380	22385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406118
618	NC_002944	GCTGA	2	10	22392	22401	20 %	20 %	40 %	20 %	41406118
619	NC_002944	CAG	2	6	22470	22475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
620	NC_002944	GAC	2	6	22527	22532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
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622	NC_002944	CAG	2	6	22599	22604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
623	NC_002944	TGG	2	6	22619	22624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406118
624	NC_002944	CAG	2	6	22635	22640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
625	NC_002944	CAA	2	6	22641	22646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406118
626	NC_002944	CGG	2	6	22689	22694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406118
627	NC_002944	TG	3	6	22702	22707	0 %	50 %	50 %	0 %	41406118
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629	NC_002944	GCCGG	2	10	22809	22818	0 %	0 %	60 %	40 %	41406119
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